BioSolvetIT infiniSee是一个虚拟筛选平台。基于相似性,它在(几乎)无限大的化学空间中找到感兴趣的分子。给定一个模板或查询分子,infiniSee 从这些化学空间或筛选库中返回相似的分子。
有了 infiniSee,您终于可以比较苹果和橘子了。infiniSee 的基本概念非常简单:我们不是搜索已经“组装”的分子,而是从“片段”中进行化合物的组合构建。片段的来源可以是组合库或任何片段生成程序。infiniSee 通过其相似性搜索技术在广阔的化学空间中导航并搜索查询分子的远邻,开启了筛选数十亿种化合物的可能性。在标准笔记本电脑上,结果通常会在不到一分钟的时间内交付。或者,您可以定义模糊药效团以增加支架的多样性或要求重要的分子结构出现在命中中。
infiniSee 的巧妙之处在于不仅可以在巨大的化学空间中进行搜索,还可以梳理不同来源的空间。由于空间的设计和设置,以及所用构建块的多样性,来自不同空间的集合中相同结构的数量被发现极低(Lessel 等人,2019 年)。无论您的内部库有多大,也无论您要添加多少化合物,它都只是您的化学家能够合成的一小部分。涉及不同的化学空间会增加您找到否则会错过的可及分子的机会。
有时,完美的解决方案在您自己的化合物库中触手可及,而无需意识到。您可以利用积累的内部知识和资源设计自己的化学空间。可以定义反应和构建块以创建大量虚拟化合物。多家大型制药公司建立了自己的内部化学空间,以寻找支架替代品以降低成本和时间。
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